• Beste gast, wij willen dit platform constant verbeteren maar hebben daarbij jouw hulp nodig!
    Wil je een paar minuten van je tijd spenderen aan deze korte enquête?

Clinlp: het startpunt voor NLP van klinische teksten

Mark Snackey

Member
Organisatie
UMC Utrecht
Als onderdeel van ons landelijke initiatief om samenwerking aan textmining en NLP voor klinische teksten te stimuleren, heeft het UMC Utrecht de afgelopen tijd gewerkt aan het open source project clinlp (https://github.com/umcu/clinlp).

Clinlp maakt het mogelijk om NLP pipelines te ontwikkelen voor Nederlandse medische teksten. Nuttig als startpunt als je íets met Nederlandse NLP wilt doen. De principes en doelstellingen waarop het gebouwd is, zijn:

Functioneel:
  • Biedt NLP pipelines geoptimaliseerd voor Nederlandse klinische tekst
    • Effectief en productieklaar
    • Inzetbaar out-of-the-box, maar zeer configureerbaar
  • (Her)gebruikt bestaande componenten waar mogelijk, implementeert nieuwe componenten waar nodig
  • Niet bedoeld voor annotatie, training en analyse - reeds gedekt door bestaande packages

Ontwikkeling:
  • Gratis en open source
  • Gericht op de technische gebruiker
  • Samengesteld en onderhouden door de Nederlandse klinische NLP gemeenschap
  • Gebouwd met behulp van het spaCy raamwerk (>3.0.0)
    • Daarom niet-destructief
  • Werkt toe naar een bepaald niveau van standaardisatie van componenten (abstractie, protocollen)
  • Volgt best practices uit de industrie (systeemontwerp, code, documentatie, testen, CI/CD)

Overkoepelende doelen:
  • Verbeteren van de kwaliteit van Nederlandse klinische NLP pipelines
  • Gemakkelijkere valorisatie en (her)gebruik van eerdere inspanningen mogelijk maken
  • Het doorontwikkelen van het veld van Nederlandse klinische NLP
  • Het helpen ontwikkelen van de Nederlandse klinische NLP gemeenschap

Clinlp is nog volop in ontwikkeling, dus als je enthousiast bent over het gebruik of als je wilt bijdragen, aarzel dan niet om contact op te nemen. We bespreken graag de ideeën en behoeften vanuit het perspectief van een (eind)gebruiker, engineer of clinicus, en formuleren samen een roadmap met volgende stappen.
 
Als onderdeel van ons landelijke initiatief om samenwerking aan textmining en NLP voor klinische teksten te stimuleren, heeft het UMC Utrecht de afgelopen tijd gewerkt aan het open source project clinlp (https://github.com/umcu/clinlp).

Clinlp maakt het mogelijk om NLP pipelines te ontwikkelen voor Nederlandse medische teksten. Nuttig als startpunt als je íets met Nederlandse NLP wilt doen. De principes en doelstellingen waarop het gebouwd is, zijn:

Functioneel:
  • Biedt NLP pipelines geoptimaliseerd voor Nederlandse klinische tekst
    • Effectief en productieklaar
    • Inzetbaar out-of-the-box, maar zeer configureerbaar
  • (Her)gebruikt bestaande componenten waar mogelijk, implementeert nieuwe componenten waar nodig
  • Niet bedoeld voor annotatie, training en analyse - reeds gedekt door bestaande packages

Ontwikkeling:
  • Gratis en open source
  • Gericht op de technische gebruiker
  • Samengesteld en onderhouden door de Nederlandse klinische NLP gemeenschap
  • Gebouwd met behulp van het spaCy raamwerk (>3.0.0)
    • Daarom niet-destructief
  • Werkt toe naar een bepaald niveau van standaardisatie van componenten (abstractie, protocollen)
  • Volgt best practices uit de industrie (systeemontwerp, code, documentatie, testen, CI/CD)

Overkoepelende doelen:
  • Verbeteren van de kwaliteit van Nederlandse klinische NLP pipelines
  • Gemakkelijkere valorisatie en (her)gebruik van eerdere inspanningen mogelijk maken
  • Het doorontwikkelen van het veld van Nederlandse klinische NLP
  • Het helpen ontwikkelen van de Nederlandse klinische NLP gemeenschap

Clinlp is nog volop in ontwikkeling, dus als je enthousiast bent over het gebruik of als je wilt bijdragen, aarzel dan niet om contact op te nemen. We bespreken graag de ideeën en behoeften vanuit het perspectief van een (eind)gebruiker, engineer of clinicus, en formuleren samen een roadmap met volgende stappen.
@Feikje Hielkema, iets voor Nictiz?
 
Terug
Bovenaan